Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A4AQ96JQ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A4AQ96JQ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms