Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC11Q96J66 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC11Q96J66 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC11Q96J66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC11Q96J66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ABCC11Q96J66 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC11Q96J66 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms