Protein–RNA interactions for Protein: Q96HZ4

HES6, Transcription cofactor HES-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES6Q96HZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HES6Q96HZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HES6Q96HZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HES6Q96HZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms