Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms