Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC97Q96F63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms