Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRRFQ96E11 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRRFQ96E11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms