Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms