Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms