Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC11Q96DB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms