Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms