Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2A3Q93084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms