Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFAP3Q92845 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms