Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRAT1Q92837 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRAT1Q92837 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRAT1Q92837 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms