Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB13Q92826 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms