Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSC1Q92574 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms