Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3S1Q92572 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3S1Q92572 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms