Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCSTNQ92542 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms