Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3CQ92520 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms