Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms