Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC4Q8WW27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms