Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms