Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR60Q8WVS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms