Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX33Q8WV41 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX33Q8WV41 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms