Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNIP1Q8TF40 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNIP1Q8TF40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms