Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms