Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA3Q8TBC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBA3Q8TBC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms