Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RP9Q8TA86 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms