Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PJA1Q8NG27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PJA1Q8NG27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PJA1Q8NG27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms