Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELBQ8NG08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms