Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA6DQ8NFY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SEMA6DQ8NFY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA6DQ8NFY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA6DQ8NFY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms