Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms