Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA4Q8NEY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms