Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC44A5Q8NCS7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A5Q8NCS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms