Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM1BQ8NB78 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms