Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNBD1Q8NA66 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNBD1Q8NA66 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNBD1Q8NA66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms