Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNLDC1Q8NA58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms