Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms