Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIML1Q8N9V2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML1Q8N9V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms