Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX3Q8N9I9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX3Q8N9I9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms