Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC89Q8N998 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms