Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M3

FITM2, Fat storage-inducing transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM2Q8N6M3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM2Q8N6M3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM2Q8N6M3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FITM2Q8N6M3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms