Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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