Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NINQ8N4C6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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