Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGSQ8N159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGSQ8N159 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGSQ8N159 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms