Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT20Q8IY31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms