Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms