Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms