Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71Q8IV32 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71Q8IV32 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms