Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRLF3Q8IUI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms