Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS2Q86VP3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms